Вариации 3D-структуры генома иммунных клеток связали с болезнью Крона
Изменения в трехмерной укладке ДНК примерно 250 генов иммунных клеток связали с болезнью Крона и другими воспалительными заболеваниями кишечника. К такому выводу пришли генетики, работа которых описана пресс-службой Фламандского института биотехнологий (VIB).
В центре внимания оказались ILC3-лимфоциты — клетки врожденной иммунной системы, контролирующие кишечный иммунитет и функции кишечника. Их давно считают важными при болезни Крона и язвенном колите, однако точный механизм до сих пор не был понятен.
Ученые из Европы, США и Японии собрали сотни тысяч таких клеток у трех доноров, пометили ДНК особыми метками и реконструировали, как геном упакован в ядрах. На этой модели они проверили, как известные мутации, повышающие риск болезни Крона, сказываются на работе генов.
Оказалось, что несколько сотен небольших изменений в структуре ДНК заметно усиливают активность около 250 генов, делая иммунные клетки более предрасположенными к воспалению. Один из ключевых генов — CLN3, ранее ассоциированный с болезнью Баттена, смертельным нейродегенеративным заболеванием. Его мутации, как выяснилось, тоже способствуют воспалительной активности иммунных клеток.
Помимо CLN3, в список попали гены HMGA1 и IKZF1. Авторы считают их перспективными целями для разработки препаратов против болезни Крона и других воспалительных заболеваний кишечника.
