Исследователи проекта «100 000 геномов» разработали алгоритм PRRDetect, способный выявлять уязвимые опухоли на основе полного анализа ДНК. Этот инструмент работает как высокоточный «сканер», находя нарушения в механизмах восстановления генетического материала, что помогает предсказать эффективность лечения.
Алгоритм протестировали на 4775 образцах различных типов рака. Результаты показали, что опухоли с дефектами пострепликативного восстановления (PRRd) особенно чувствительны к иммунотерапии. Это открытие может серьезно повлиять на разработку персонализированных схем лечения.
Технология уже применяется для изучения таких форм рака, как кишечный, кожный, мозговой, легочный и другие. PRRDetect помогает врачам понять, у каких пациентов выше вероятность успеха при иммунотерапии, что повышает шансы на выживание и снижает риск ошибок в назначении лечения.
Метод основан на анализе мутаций типа «индел», позволившем выделить 37 различных моделей повреждений ДНК — часть из них связана с курением, ультрафиолетом и другими известными канцерогенами.